5  Workflow: code style

You are reading the work-in-progress second edition of R for Data Science. This chapter is largely complete and just needs final proof reading. You can find the complete first edition at https://r4ds.had.co.nz.

良好的编码风格就像正确的标点符号:你可以不用它来管理,但它肯定会让事情更容易阅读。 即使作为一个非常新的程序员,研究您的代码风格也是一个好主意。 使用一致的风格可以让其他人(包括未来的你!)更容易阅读你的作品,如果你需要从别人那里获得帮助,这一点尤为重要。 本章将介绍整本书中使用的 tidyverse style guide 的最重要的要点。

设计代码样式一开始会觉得有点乏味,但如果你练习它,它很快就会成为第二天性。 此外,还有一些很棒的工具可以快速重新设计现有代码的样式,例如 Lorenz Walthert 的 styler 包。 使用 install.packages("styler") 安装后,使用它的一种简单方法是通过 RStudio 的命令面板(command palette)。 命令面板允许您使用任何内置的 RStudio 命令和包提供的许多插件。 按 Cmd/Ctrl + Shift + P 打开调色板,然后键入 “styler” 以查看 styler 提供的所有快捷方式。 Figure 5.1 显示了结果。

A screenshot showing the command palette after typing "styler", showing the four styling tool provided by the package.

Figure 5.1: RStudio’s command palette makes it easy to access every RStudio command using only the keyboard.

在本章中,我们将使用 tidyverse 和 nycflights13 包作为代码示例。

library(tidyverse)
#> Warning: package 'tidyverse' was built under R version 4.2.3
#> Warning: package 'ggplot2' was built under R version 4.2.3
#> Warning: package 'tibble' was built under R version 4.2.3
#> Warning: package 'tidyr' was built under R version 4.2.3
#> Warning: package 'readr' was built under R version 4.2.3
#> Warning: package 'purrr' was built under R version 4.2.3
#> Warning: package 'dplyr' was built under R version 4.2.3
#> Warning: package 'stringr' was built under R version 4.2.2
#> Warning: package 'forcats' was built under R version 4.2.3
#> Warning: package 'lubridate' was built under R version 4.2.3
library(nycflights13)
#> Warning: package 'nycflights13' was built under R version 4.2.3

5.1 Names

我们在 Section 3.3 中简要讨论了 names。 请记住,变量名(由 <- 创建的和由 mutate() 创建的)应仅使用小写字母、数字和 _。 使用 _ 分隔名称中的单词。

# Strive for:
short_flights <- flights |> filter(air_time < 60)

# Avoid:
SHORTFLIGHTS <- flights |> filter(air_time < 60)

作为一般经验法则,最好选择易于理解的长描述性名称,而不是快速键入的简洁名称。 短名称在编写代码时节省的时间相对较少(尤其是因为自动完成功能会帮助您完成输入),但当您返回旧代码并被迫拼出一个神秘的缩写时,它可能会很耗时。

如果您有一堆相关事物的名称,请尽量保持一致。 当您忘记以前的约定时很容易出现不一致,所以如果您不得不返回并重命名事物,请不要难过。 一般来说,如果你有一堆变量是同一个主题的变体,你最好给它们一个共同的前缀而不是一个共同的后缀,因为自动完成在变量的开头效果最好。

5.2 Spaces

除了 ^(即 +-==<、…)和赋值运算符 (<-) 外,在数学运算符的两边放置空格。

# Strive for
z <- (a + b)^2 / d

# Avoid
z<-( a + b ) ^ 2/d

不要在常规函数调用的括号内或括号外放置空格。 总是在逗号后加一个空格,就像标准英语一样。

# Strive for
mean(x, na.rm = TRUE)

# Avoid
mean (x ,na.rm=TRUE)

如果可以改善对齐方式,可以添加额外的空格。 例如,如果您在 mutate() 中创建多个变量,您可能需要添加空格以便所有 = 排成一行。1 这样可以更轻松地浏览代码。

flights |> 
  mutate(
    speed      = distance / air_time,
    dep_hour   = dep_time %/% 100,
    dep_minute = dep_time %%  100
  )

5.3 Pipes

|> 前面应该始终有一个空格,并且通常应该放在一行的最后。 这使得添加新步骤、重新排列现有步骤、修改步骤中的元素以及通过浏览左侧的 verbs 获得 10,000 英尺的视图变得更加容易。

# Strive for 
flights |>  
  filter(!is.na(arr_delay), !is.na(tailnum)) |> 
  count(dest)

# Avoid
flights|>filter(!is.na(arr_delay), !is.na(tailnum))|>count(dest)

如果您要输入的函数具有命名参数(如 mutate()summarize()),请将每个参数放在一个新行中。 如果函数没有命名参数(如 select()filter()),请将所有内容放在一行中,除非它不适合,在这种情况下,您应该将每个参数放在自己的行中。

# Strive for
flights |>  
  group_by(tailnum) |> 
  summarize(
    delay = mean(arr_delay, na.rm = TRUE),
    n = n()
  )

# Avoid
flights |>
  group_by(
    tailnum
  ) |> 
  summarize(delay = mean(arr_delay, na.rm = TRUE), n = n())

在流水线的第一步之后,每行缩进两个空格。 RStudio 会在 |> 后的换行符后自动为您添加空格。 如果您将每个参数放在自己的行中,请额外缩进两个空格。 确保 ) 独占一行,并且未缩进以匹配函数名称的水平位置。

# Strive for 
flights |>  
  group_by(tailnum) |> 
  summarize(
    delay = mean(arr_delay, na.rm = TRUE),
    n = n()
  )

# Avoid
flights|>
  group_by(tailnum) |> 
  summarize(
             delay = mean(arr_delay, na.rm = TRUE), 
             n = n()
           )

# Avoid
flights|>
  group_by(tailnum) |> 
  summarize(
  delay = mean(arr_delay, na.rm = TRUE), 
  n = n()
  )

如果您的管道很容易放在一条线上,那么可以避开其中一些规则。 但根据我们的集体经验,短片段变长是很常见的,因此从长远来看,从所需的所有垂直空间开始通常会节省时间。

# This fits compactly on one line
df |> mutate(y = x + 1)

# While this takes up 4x as many lines, it's easily extended to 
# more variables and more steps in the future
df |> 
  mutate(
    y = x + 1
  )

最后,要小心写很长的管道,比如超过 10-15 行。 试着把它们分解成更小的子任务,给每个任务一个信息丰富的名称。 这些名称将有助于提示读者了解正在发生的事情,并更容易检查中间结果是否符合预期。 每当你可以给一些东西一个信息性名称时,你应该给它一个信息性名称,例如当你从根本上改变数据的结构时,例如,在旋转或总结之后。 不要指望第一次就做对! 这意味着如果存在可以获得好名字的中间状态,则打破长管道。

5.4 ggplot2

适用于管道的相同基本规则也适用于 ggplot2;只需将 + 视为与 |> 相同的方式。

flights |> 
  group_by(month) |> 
  summarize(
    delay = mean(arr_delay, na.rm = TRUE)
  ) |> 
  ggplot(aes(x = month, y = delay)) +
  geom_point() + 
  geom_line()

同样,如果您不能将函数的所有参数放在一行中,请将每个参数放在其自己的行中:

flights |> 
  group_by(dest) |> 
  summarize(
    distance = mean(distance),
    speed = mean(distance / air_time, na.rm = TRUE)
  ) |> 
  ggplot(aes(x = distance, y = speed)) +
  geom_smooth(
    method = "loess",
    span = 0.5,
    se = FALSE, 
    color = "white", 
    linewidth = 4
  ) +
  geom_point()

注意从 |>+ 的过渡。 我们希望这种转换不是必需的,但不幸的是,ggplot2 是在发现管道之前编写的。

5.5 Sectioning comments

随着您的脚本变长,您可以使用 sectioning 注释将您的文件分解成可管理的部分:

# Load data --------------------------------------

# Plot data --------------------------------------

RStudio 提供了一个键盘快捷键来创建这些标题(Cmd/Ctrl + Shift + R),并将它们显示在编辑器左下角的代码导航下拉列表中,如 Figure 5.2 所示。

Figure 5.2: After adding sectioning comments to your script, you can easily navigate to them using the code navigation tool in the bottom-left of the script editor.

5.6 Exercises

  1. 按照上述指南重新设计以下管道。

    flights|>filter(dest=="IAH")|>group_by(year,month,day)|>summarize(n=n(),
    delay=mean(arr_delay,na.rm=TRUE))|>filter(n>10)
    
    flights|>filter(carrier=="UA",dest%in%c("IAH","HOU"),sched_dep_time>
    0900,sched_arr_time<2000)|>group_by(flight)|>summarize(delay=mean(
    arr_delay,na.rm=TRUE),cancelled=sum(is.na(arr_delay)),n=n())|>filter(n>10)

5.7 Summary

在本章中,您学习了代码风格的最重要原则。 从这些开始可能感觉像是一组任意规则(因为它们确实如此!),但随着时间的推移,随着您编写更多代码并与更多人共享代码,您会发现一致的风格是多么重要。 并且不要忘记 styler 包:它是快速提高样式不佳代码质量的好方法。

在下一章中,我们将切换回数据科学工具,学习整理数据。 Tidy data 是组织数据框的一致方式,在整个 tidyverse 中使用。 这种一致性让您的生活更轻松,因为一旦您拥有整洁的数据,它就可以与绝大多数 tidyverse 函数一起使用。 当然,生活从来都不是一帆风顺的,您在野外遇到的大多数数据集都不是整洁的。 因此,我们还将教您如何使用 tidyr 包来整理您不整洁的数据。


  1. 由于 dep_timeHMMHHMM 格式,我们使用整数除法(%/%)得到 hour,使用余数(也称为取模,%%)得到 minute。↩︎